<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">vuzbiochemi</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Proceedings of Universities. Applied Chemistry and Biotechnology</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2227-2925</issn><issn pub-type="epub">2500-1558</issn><publisher><publisher-name>ИРНИТУ</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">.org/10.21285/2227-2925-2019-9-1-44-52</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">vuzbiochemi-172</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>PHYSICOCHEMICAL BIOLOGY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Анализ микробных фосфолипидов в процессах биомониторинга состояния почв</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Analysis of microbial phospholipids in processes оf biomonitoring of soil condition</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Хабибуллина</surname><given-names>А. Р.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Khabibullina</surname><given-names>A. R.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">aida_khabibullin@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Вдовина</surname><given-names>Т. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vdovina</surname><given-names>T. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">tvkirilina@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сироткин</surname><given-names>А. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Sirotkin</surname><given-names>A. S.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">asirotkin66@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Трёгл</surname><given-names>Й.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Trögl</surname><given-names>J.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">Josef.Trogl@ujep.cz</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Бровдыова</surname><given-names>Т.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Brovdyová</surname><given-names>T.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">tatjana.brovdyova@ujep.cz</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Куран</surname><given-names>П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kuráň</surname><given-names>P.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">P.Kuran@gmx.de</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Казанский национальный исследовательский технологический университет</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Kazan National Research Technological University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>Университет Яна Евангелиста Пуркине</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>University of Jan Evangelista Purkine</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2019</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>23</day><month>09</month><year>2019</year></pub-date><volume>9</volume><issue>1</issue><fpage>44</fpage><lpage>52</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Хабибуллина А.Р., Вдовина Т.В., Сироткин А.С., Трёгл Й., Бровдыова Т., Куран П., 2019</copyright-statement><copyright-year>2019</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Хабибуллина А.Р., Вдовина Т.В., Сироткин А.С., Трёгл Й., Бровдыова Т., Куран П.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Khabibullina A.R., Vdovina T.V., Sirotkin A.S., Trögl J., Brovdyová T., Kuráň P.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://vuzbiochemi.elpub.ru/jour/article/view/172">https://vuzbiochemi.elpub.ru/jour/article/view/172</self-uri><abstract><p>Целью данной работы являлась оценка возможности применения метода анализа фосфо-липидных жирных кислот в составе липидов клеточных мембран почвенных микроорганизмов для мо- ниторинга состояния почв в процессе восстановления. Экспериментальная часть заключалась в определении фосфолипидных жирных кислот (ФЛЖК), включающая экстракцию фосфолипидов органическими растворителями, выделение липидной фракции с помощью полярных силикатных колонок, получение метиловых эфиров жирных кислот путем щелочного метанолиза и анализа содержания ФЛЖК методом газовой хроматографии. Идентификация микроорганизмов осуществлялась на основании оценки полученных экспериментальных результатов, представляющих собой совокупность пиков хроматограммы. Воздействие стрессовых факторов на микроорганизмы определяют по наличию цис-транс-изомерии или циклов из трех атомов углерода на концах радикалов фосфолипидных жирных кислот. С целью проверки объективности результатов, полученных с помощью предлагаемого метода анализа микроорганизмов, в данной работе использовался также традиционный метод контроля почвенных микроорганизмов на основании активности их ферментов - глюкозидаз, протеаз, арилсульфатаз, фосфатаз. Полученные данные свидетельствуют о наличии жизнеспособных почвенных микроорганизмов. Однако их количество не соответствует контрольным пробам, что говорит о незавершении процессов восстановления. Результаты идентификации демонстрируют доминирование грамотрицательных (Гр-) бактерий в контрольных пробах в сравнении с пробами в условиях естественного восстановления. При этом в процессе естественного восстановления в почве обнаружено большее количество грибов. Согласно полученным данным, наибольшее количество цис-изомеров и значение циклизации фосфолипидных жирных кислот характерны для микроорганизмов в контрольных пробах, что может быть обусловлено истощением субстрата при использовании почвы в сельскохозяйственных целях. Экспериментальные данные, полученные в ходе данной работы, позволяют предложить использование процедуры анализа фосфолипидных жирных кислот в составе липидов клеточных мембран как самостоятельный метод для проведения биологического мониторинга экосистем. </p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The purpose of this work was to assess the possibility of applying the method of phospholipid fatty acid analysis in the composition of lipids of cell membranes of soil microorganisms for monitoring the state of the soil in the process of recovery. The experimental part consisted in a determination of phospholipid fatty acids (FFA), including extraction of phospholipids with organic solvents, extraction of the lipid fraction using polar silicate columns, preparation of methyl esters of fatty acids by alkaline methanolysis and analysis of the content of FFA with gas chromatography. The identification of microorganisms was carried out on the basis of an evaluation of the experimental results obtained, which are represented by a combination of chromatogram peaks. The impact of stress factors on microorganisms is determined by the presence of cis-trans-isomerism or cycles of three carbon atoms at the ends of phospholipid fatty acid radicals. In order to verify the objectivity of the results obtained using the proposed method for analysing microorganisms, this work also used the traditional method of controlling soil microorganisms based on the activity of their enzymes - glucosidases, proteases, arylsulphatases and phosphatases. The data obtained indicate the presence of viable soil microorganisms; however, their number does not match the control samples, indicating a failure of the recovery process. The identification results demonstrate the dominance of Gram-negative (Gr-) bacteria in the control samples in comparison with the samples in conditions of natural recovery. At the same time, in the process of natural restoration, a greater quantity of fungi was found in the soil. According to the data obtained, the largest amounts of cis - isomers and the value of cyclisation of phospholipid fatty acids are characteristic of microorganisms in the control samples, which may be due to the depletion of the substrate when using the soil for agricultural purposes. The experimental data obtained in the course of this work allow us to propose the procedure as an independent method for conducting biological monitoring of ecosystems when analysing phospholipid fatty acids in the composition of cell membrane lipids. </p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>почва</kwd><kwd>почвенные микроорганизмы</kwd><kwd>ферментативная активность</kwd><kwd>фосфолипиды</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>soil</kwd><kwd>microorganisms of soil</kwd><kwd>fermentative activity</kwd><kwd>phospholipids</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шлегель Г. Общая микробиология / пер. с нем.; 6-е изд., перераб. и доп. М.: Мир, 1987. 567 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Шлегель Г. Общая микробиология / пер. с нем.; 6-е изд., перераб. и доп. М.: Мир, 1987. 567 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ахметшина Э.А., Сироткин А.С. Анализ фосфолипидных жирных кислот микроорганизмов как биомаркеров окружающей среды // Вестник Казанского технологического университета. 2014. Т. 17. N19. С. 233-236.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ахметшина Э.А., Сироткин А.С. Анализ фосфолипидных жирных кислот микроорганизмов как биомаркеров окружающей среды // Вестник Казанского технологического университета. 2014. Т. 17. N19. С. 233-236.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kuráň P., Trӧgl J., Nováková J., Pilařová V., Dá-ňová P., Pavlorková J., Kozler J., Novák F., Popelka J. Biodegradation of spilled diesel fuel in agricultural soil: Effect of humates, zeolite and bioaugmentation // The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014. 8 p. http://dx.doi.org/10.1155/2014/642427</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kuráň P., Trӧgl J., Nováková J., Pilařová V., Dá-ňová P., Pavlorková J., Kozler J., Novák F., Popelka J. Biodegradation of spilled diesel fuel in agricultural soil: Effect of humates, zeolite and bioaugmentation // The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014. 8 p. http://dx.doi.org/10.1155/2014/642427</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Trögl J., Jirková I., Zemánková P. et al. Estimation of the quantity of bacteria encapsulated in Lentikats Biocatalyst via phospholipid fatty acids content: a preliminary study // Folia Microbiol. 2013. Vol. 58. P. 135-140.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Trögl J., Jirková I., Zemánková P. et al. Estimation of the quantity of bacteria encapsulated in Lentikats Biocatalyst via phospholipid fatty acids content: a preliminary study // Folia Microbiol. 2013. Vol. 58. P. 135-140.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Trögl J., Jirkova,I., Kuran P., Achmetshina E., Brovdyova T., Sirotkin A., Kirilina T. Phospholipid Fatty Acids as Physiological Indicators of Paracoccus Denitrificans Encapsulated in Silica Sol-Gel Hydrogels // Sensors. 2015. No. 15. P. 3426-3434.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Trögl J., Jirkova,I., Kuran P., Achmetshina E., Brovdyova T., Sirotkin A., Kirilina T. Phospholipid Fatty Acids as Physiological Indicators of Paracoccus Denitrificans Encapsulated in Silica Sol-Gel Hydrogels // Sensors. 2015. No. 15. P. 3426-3434.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Federici E., Giubilei M.A., Cajthaml T., Petruccioli M., D’Annibale A. Lentinus (Panus) Tigrinus augmentation of a historically contaminated soil: Matrix Decontamination and Structure and Function of the Resident Bacterial Community // Journal Hazard. Mater. 2011. No 186. P. 1263-1270.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Federici E., Giubilei M.A., Cajthaml T., Petruccioli M., D’Annibale A. Lentinus (Panus) Tigrinus augmentation of a historically contaminated soil: Matrix Decontamination and Structure and Function of the Resident Bacterial Community // Journal Hazard. Mater. 2011. No 186. P. 1263-1270.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Trögl J., Pavlorková J., Packová P., Seják J., Kuráň P., Popelka J., Pacina J. Indication of Importance of Including Soil Microbial Characteristics into Biotope Valuation Method // Sustainability. 2016. No. 8. P. 253-263.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Trögl J., Pavlorková J., Packová P., Seják J., Kuráň P., Popelka J., Pacina J. Indication of Importance of Including Soil Microbial Characteristics into Biotope Valuation Method // Sustainability. 2016. No. 8. P. 253-263.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mjøs S.A. Identiﬁcation of Fatty Acids in Gas Chromatography by Application of Different Temperature and Pressure Programs on a Single Capillary Column // Journal Chromatogr. A 2003. Vol. 1015. P. 151-161.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mjøs S.A. Identiﬁcation of Fatty Acids in Gas Chromatography by Application of Different Temperature and Pressure Programs on a Single Capillary Column // Journal Chromatogr. A 2003. Vol. 1015. P. 151-161.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Miwa T.K., Mikolajczak K.L., Earle F.R., Wolff I.A. Identification of peaks in gas-liquid chromatography // Anal. Chem. 1960. No. 32. P. 1739-1742.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Miwa T.K., Mikolajczak K.L., Earle F.R., Wolff I.A. Identification of peaks in gas-liquid chromatography // Anal. Chem. 1960. No. 32. P. 1739-1742.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Хазиев Ф.Х. Методы почвенной энзимологии. М.: Наука, 2005. 252 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Хазиев Ф.Х. Методы почвенной энзимологии. М.: Наука, 2005. 252 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Baldrian P., Trögl J., Frouz J., Šnajdr J.,Valaskova V., Merhautova V., Cajthaml T., Herinkova J. Enzyme activities and microbial biomass in top soil layer during spontaneous succession in spoil heaps afterbrown coal mining // Soil. Biol. Biochem. 2008. No. 40. P. 2107-2115.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Baldrian P., Trögl J., Frouz J., Šnajdr J.,Valaskova V., Merhautova V., Cajthaml T., Herinkova J. Enzyme activities and microbial biomass in top soil layer during spontaneous succession in spoil heaps afterbrown coal mining // Soil. Biol. Biochem. 2008. No. 40. P. 2107-2115.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Иванова Т.И., Кузьмина Н.П., Саввинов Д.Д. Численность микроорганизмов в мерзлотных почвах аласа Мюрю // Наука и образование. 2007. N 2. С. 76-82.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Иванова Т.И., Кузьмина Н.П., Саввинов Д.Д. Численность микроорганизмов в мерзлотных почвах аласа Мюрю // Наука и образование. 2007. N 2. С. 76-82.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Голованов А.И., Зимин Ф.М., Сметанин В.И. Рекультивация нарушенных земель: учебник для вузов; 2-е изд., испр. и доп. СПб.: Лань, 2015. 336 с</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Голованов А.И., Зимин Ф.М., Сметанин В.И. Рекультивация нарушенных земель: учебник для вузов; 2-е изд., испр. и доп. СПб.: Лань, 2015. 336 с</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Жукова Н.В. Жирные кислоты морских организмов: таксономические и трофические маркеры: Автореферат дис. … д-ра биолог. наук: 03.00.04. Владивосток, 2009. 267 с</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Жукова Н.В. Жирные кислоты морских организмов: таксономические и трофические маркеры: Автореферат дис. … д-ра биолог. наук: 03.00.04. Владивосток, 2009. 267 с</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
